http://natalia.grabar.free.fr/these2016eq.html
Date limite de candidature : 31 mai 2016
Le sujet de thèse proposé concerne l'e-Qualité des dossiers cliniques et porte sur la vérification de la qualité des soins médicaux et des prescriptions grâce à l'utilisation de méthodes de TAL.
Le travail est effectué avec des données cliniques en français.
e-Qualité constitue une étape importante pour assurer l'efficacité des soins et leur sécurité pour le patient [1]. L'objectif est de mettre en place des méthodologies TAL efficaces et reproductibles qui permettent de définir, d'extraire et d'analyser les indicateurs de qualité relatifs à une question donnée. Le cas d'étude concerne la prescription des anticoagulants oraux. En effet, la pertinence des prescriptions d’anticoagulants oraux (Anti-Vitamines K et Anticoagulants Oraux Directs) constitue un enjeu majeur pour l’amélioration de la qualité, de la sécurité et de l’efficience des soins [2-4]. De plus, ce type de prescriptions touche une population importante [5].
Cette thèse aura pour objectif de proposer des méthodes automatiques pour cibler et extraire les indicateurs définis par les spécialistes (médecins, pharmaciens, pharmacovigilants...) [6-8]. Leur détection sera effectuée dans des documents non structurés et des données structurées [9-13]. Une évaluation sera effectuée pour statuer sur l'utilisabilité de méthodes sur différents types de données et dans différentes institutions cliniques.
La thèse offre une possibilité de collaboration inter-disciplinaire et réunit l'expertise de plusieurs domaines : TAL, linguistique et informatique de manière directe, mais aussi des interactions nécessaires avec des spécialistes du domaine médical (médecins, pharmaciens, pharmacovigilants...) lors de la définition des indicateurs et de l'évaluation des méthodes de TAL.
Requis pour les candidats :
- être titulaire d'un M2 au 23 juin 2016 (au plus tard en juillet 2016)
- avoir une moyenne de M2 de 16/20 ou équivalent
- maîtriser les méthodes de TAL (extraction d'information, terminologies...)
- avoir la capacité de travailler de manière autonome et en équipe
Encadrement : Ilse Depraetere et Natalia Grabar
Lieu : UMR8163 STL, Université Lille 3
Les dossiers de candidature sont à envoyer à natalia.grabar@univ-lille3.fr
Les dossiers (format pdf) doivent comporter :
- le CV du candidat montrant les compétences par rapport au sujet
- la lettre de motivation ciblée sur le sujet
- le programme du M2
- le relevé de notes de M2
- 2 référents
Références :
- Haute Autorité de Santé. Evaluer la pertinence des soins : une démarche de progrès. 2011. Disponible sur: http://www.hassante.fr/portail/jcms/c_1197428/fr/evaluer-la-pertinence-des-soins-une-demarche-deprogres?xtmc=&xtcr=5
- Pouyanne P, Haramburu F, Imbs JL, Bégaud B. Admissions to hospital caused by adverse drug reactions: cross sectional incidence study. French Pharmacovigilance Centres. BMJ. 2000;320(7241):1036.
- Queneau P, Bannwarth B, Carpentier F, Guliana J-M, Bouget J, Trombert B, et al. Emergency department visits caused by adverse drug events: results of a French survey. Drug Saf. 2007;30(1):81-8.
- Michel P, Minodier C, Lathelize M, Moty-Monnereau C, Domecq S, Chaleix M, Izotte-Kret M, Bru-Sonnet R, Quenon JL, Olier L. Les événements indésirables graves associés aux soins observés dans les établissements de santé. Dossiers Solidarité et Santé, DREES, n°17. 2010. Disponible sur: http://www.drees.sante.gouv.fr/les-evenements-indesirables-graves-associes-aux-soinsobserves-dans-les-etablissements-de-sante,7390.html
- Agence Nationale de Sécurité du Médicament et des Produits de santé. Les anticoagulants en France en 2014 : état des lieux, synthèse et surveillance. 2014. Disponible sur: http://ansm.sante.fr/
- Haute Autorité de Santé. Indicateurs de pratique clinique Infarctus du myocarde (IDM) « Des 1ers signes au suivi à 1 an ». 2012. Disponible sur: http://www.has-sante.fr/portail/upload/docs/application/pdf/2012-07/04_indicateurs_idm_actualisation_2012_vf.pdf
- Haute Autorité de Santé. Indicateurs de pratique clinique AVC. 2010. Disponible sur: http://www.hassante.fr/portail/upload/docs/application/pdf/2010-06/ipc_avc_vf_22062010.pdf
- Haute Autorité de Santé. Prévenir la iatrogénie et améliorer la prescription médicamenteuse chez le sujet âgé. 2012. Disponible sur: http://www.has-sante.fr/portail/upload/docs/application/pdf/2013-08/2.1_has_intro_pleniere_pmsa_2012_vf.pdf
- Kerr GS, Richards JS, Nunziato CA, Patterson OV, DuVall SL, Aujero M, Maron D, Amdur R. Measuring physician adherence with gout quality indicators: a role for natural language processing. Arthritis Care Res (Hoboken). 2015 Feb;67(2):273-9. doi: 10.1002/acr.22406.
- Gawron AJ, Thompson WK, Keswani RN, Rasmussen LV, Kho AN. Anatomic and advanced adenoma detection rates as quality metrics determined via natural language processing. Am J Gastroenterol. 2014 Dec;109(12):1844-9. doi: 10.1038/ajg.2014.147. Epub 2014 Jun 17.
- Garvin JH, Elkin PL, Shen S, Brown S, Trusko B, Wang E, Hoke L, Quiaoit Y, Lajoie J, Weiner MG, Graham P, Speroff T. Automated quality measurement in Department of the Veterans Affairs discharge instructions for patients with congestive heart failure. J Healthc Qual. 2013 Jul-Aug;35(4):16-24. doi: 10.1111/j.1945-1474.2011.195.x.
- Mehrotra A, Dellon ES, Schoen RE, Saul M, Bishehsari F, Farmer C, Harkema H. Applying a natural language processing tool to electronic health records to assess performance on colonoscopy quality measures. Gastrointest Endosc. 2012 Jun;75(6):1233-9.e14. doi: 10.1016/j.gie.2012.01.045. Epub 2012 Apr 4.
- Henderson KE, Recktenwald Aj, Reichley RM, Bailey TC, Waterman BM, Diekemper RL, Storey PE, Ireland BK, Dunagan WC. Clinical validation of the AHRQ postoperative venous thromboembolism patient safety indicator. Jt Comm J Qual Patient Saf. 2009 Jul;35(7):370-6.