La qualité de vie et la santé des personnes dépendent de
plusieurs facteurs, parmi lesquels se trouvent par exemple
l'environnement, le contexte social, psychologique et
économique, la médecine et la qualité des soins médicaux,
la situation géographique et l'alimentation. Cela crée une
situation d'autant plus complexe que ces facteurs
interagissent naturellement entre eux. Ces différents
facteurs sont souvent étudiés par les chercheurs de
différentes disciplines, ce qui ne reflète pas la
complexité de la situation et l'imbrication de ces
facteurs. Nous pensons que les travaux de recherche
interdisciplinaires permettent de décrire et de modéliser
mieux la situation. De plus, ils conduisent vers de
nouvelles connaissances et ouvrent de nouvelles
perspectives en rupture avec les travaux existants.
Nous proposons d'étudier en parallèle les interactions
qui peuvent exister entre les pathologies, les médicaments
et l'alimentation (aliments et boissons). Si le lien entre
les médicaments et les pathologies a déjà fait l'objet de
multiples travaux, leur relation avec l'alimentation n'a
pas été beaucoup étudiée. Nous avons réuni des partenaires
provenant de différentes disciplines (informatique,
linguistique, médecine, Traitement Automatique de Langues
ou TAL) et représentant différentes thématiques de
recherche (morphologie, représentation de connaissances,
santé publique, pharmacovigilance, informatique médicale,
extraction d'information, visualisation). Pour mieux
étudier les interactions entre plusieurs des facteurs
mentionnés, nous proposons une collaboration
interdisciplinaire afin de compléter mutuellement les
méthodes et les résultats.
Objectifs
L'objectif principal de notre projet est de proposer une
collaboration interdisciplinaire pour étudier plus
précisément les différents facteurs en relation avec la
santé des personnes. Plus spécifiquement, nous proposons
de nous concentrer sur les relations qui peuvent exister
entre les pathologies, les médicaments et
l'alimentation. Les types de relations entre ces éléments
peuvent être assez variées:
- les médicaments sont typiquement utilisés pour
soigner les pathologies, mais certains médicaments
peuvent aussi provoquer des pathologies que l'on
associe alors aux EIM (effets indésirables de
médicaments);
- l'alimentation doit être surveillée avec certaines
pathologies (comme le diabète, l'hypertension, les
maladies cardio-vasculaires ou les maladies hépatiques)
mais elle doit également être adaptée aux médicaments
administrés aux personnes. Par exemple, plus de 85
médicaments oraux interagissent avec le pamplemousse, dont
43 peuvent avoir des conséquences graves sur la santé du
patient car certaines molécules contenues dans le
pamplemousse inhibent des enzymes qui participent au
métabolisme des médicaments provoquant ainsi un risque de
surdosage de ceux-ci. L'aliment qui interagit sûrement
avec le plus de médicaments est bien sûr l'alcool sous
toutes ses formes.
Nous proposons donc d'étudier les relations qui existent
entre ces trois facteurs (pathologies, médicaments et
alimentation) en exploitant des bases de données déjà
disponibles (comme les bases PharmGKB ou DrugBank). À
notre connaissance, peu de données de ce type en relation
avec les aliments sont disponibles publiquement.
Nous allons aussi analyser, de manière expérimentale, la
littérature scientifique afin de proposer des
méthodologies pour extraire automatiquement de nouvelles
connaissances.
La méthodologie fera appel aux méthodes de plusieurs
disciplines (informatique, traitement automatique des
langues, linguistique, médecine et santé publique,
pharmacovigilance, représentation de connaissances et
visualisation) afin de pouvoir accéder aux informations et
de les organiser.
Publications et réalisations
-
Thierry Hamon, Fleur Mougin, Natalia Grabar
Generating and Executing Complex Natural Language Queries across Linked Data
MEDINFO 2015: Medical Informatics. 19-23 August, 2015, Sao-Paulo, Brasil
To appear.
-
Thierry Hamon, Natalia Grabar, Fleur Mougin, Frantz Thiessard
Description of the POMELO system for the task 2 of QALD-2014
QA Track - CLEF Question Answering Track. Sheffield, UK.
pdf
